在藥物分析研究領域也有著重要的意義。雖說在藥物研發(fā)中的雜質(zhì)研究和藥物動力學研究階段，通常雜質(zhì)和藥代動力學樣品的血藥濃度的含量很低，分析難度大且干擾多，但液質(zhì)聯(lián)用技術由于其選擇性強和靈敏度高，可以快速準確地測定藥物分析中的痕量物質(zhì)，且儀器能夠?qū)史肿与x子進行多級裂解，從而提供化合物的相對分子量以及豐富的碎片信息。

　　二手液質(zhì)聯(lián)用儀不僅能夠定性定量檢測禽畜肉和農(nóng)作物等食品中的藥物殘留，提供檢測物質(zhì)的結構信息而且精密度高、重現(xiàn)性好，能夠排除假陽性檢測結果。液質(zhì)聯(lián)用技術能夠快速簡便地檢測肉制品中的氯霉素、氟苯尼考、雪卡毒素等有害物質(zhì)，特別是在檢測農(nóng)藥殘留方面快捷有效，故而液質(zhì)聯(lián)用在食品安全分析領域也起著重要的作用。

　　除了在上述領域受重視外，在藥物代謝及藥物動力學研究、臨床藥理學研究、天然藥物(中草藥等)開發(fā)研究、新生兒篩選、蛋白與肽類的鑒定、殘留分析、毒物分析、環(huán)保、食品、自來水、衛(wèi)生防疫等行業(yè)也有著發(fā)揮著積極的作用。